وُضع حجر الأساس لمدينة زويل للعلوم والتكنولوجيا في الأول من يناير 2000 حيث تقع في حي الشيخ زايد بمدينة السادس من أكتوبر, القاهرة. أقيم الحفل بحضور الدكتور أحمد زويل الحفل يرافقه رئيس الوزراء آنذاك الدكتور عاطف عبيد وعدد من الوزراء من بينهم الدكتور أحمد نظيف الذي أصبح رئيسا لمجلس الوزراء فيما بعد.
بعد العديد من التأخيرات في إنشاء المدينة ، أدت ثورة 25 يناير 2011 إلى إحياء المبادرة ، وطلبت الحكومة المصرية من الدكتور زويل تشكيل المجلس الاستشاري الأعلى وإعادة إطلاق المبادرة على موقعها الأصلي. في 11 مايو 2011 أصدر مجلس الوزراء قراراً بإنشاء المشروع القومي للنهضة العلمية ، وأطلق عليه اسم مدينة زويل للعلوم والتكنولوجيا.